• 曾获国家自然科学二等奖（第一完成人2次，第四完成人1次）

• 国际人类基因组组织（HUGO）卓越科学成就奖

• 谈家桢生命科学成就奖、谈家桢生命科学创新奖

• 何梁何利基金科技进步奖

• 教育部自然科学一等奖

• 上海市科技精英、以及省部级科技进步一等奖等奖励

1.Zhang M, Yan S, Pan W, Jin L. Phylogenetic evidence for Sino-Tibetan origin in northern China in the Late Neolithic. Nature. 2019; 569: 112-115. 

2.Kamberov Y G, Wang S, Tan J, Gerbault P, Wark A, Tan L, Yang Y, Li S, Tang K, Chen H, Powell A, Itan Y, Fuller D, Lohmueller J, Mao J, Schachar A, Paymer M, Hostetter E, Byrne E, Burnett M, Mcmahon A P, Thomas M G, Lieberman D E, Jin L, Tabin C J, Morgan B A, Sabeti P C. Modeling recent human evolution in mice by expression of a selected EDAR variant. Cell. 2013; 152: 691-702. 

3.The HUGO Pan-Asian SNP Consortium (Li Jin, Edison T. Liu, Mark Seielstad, Shuhua Xu; 93 authors from 10 countries). Mapping Genetic Diversity in Asia. Science. 2009, 326:1541-1545. 

4.Wen B, Hui L, Lu D, Song X, Zhang F, He Y, Li F, Gao Y, Mao X, Zhang L, Qian J, Tan J, Jin J, Huang W, Deka R, Su B, Chakraborty R,  Jin L. Genetic evidence supports demic diffusion of Han culture. Nature. 2004; 431: 302-305.

5.Ke Y, Su B, Song X, Lu D, Chen L, Li H, Qi C, Marzuki S, Deka R, Underhill P, Xiao C, Shriver M, Lell J, Wallace D, Wells R S, Seielstad M, Oefner P, Zhu D, Jin J, Huang W, Chakraborty R, Chen Z, Jin L. African origin of modern humans in East Asia: A tale of 12,000 Y chromosomes. Science. 2001; 292: 1151-1153.

• 曾获国家自然科学二等奖（第一完成人2次，第四完成人1次）

• 国际人类基因组组织（HUGO）卓越科学成就奖

• 谈家桢生命科学成就奖、谈家桢生命科学创新奖

• 何梁何利基金科技进步奖

• 教育部自然科学一等奖

• 上海市科技精英、以及省部级科技进步一等奖等奖励